Реализация дополнительных общеобразовательных общеразвивающих программ осуществляется по четырем образовательным центрам: Центр гражданско-патриотического воспитания, Центр естественно-научного и технического творчества «ProЦЕНТ²», Центр этнокультурного воспитания, Центр художественно-эстетического воспитания. В структуру учреждения также входит Центр методического и психологического сопровождения, цель работы - достижение эффективности и обеспечения качества методического сопровождения образовательной деятельности ДДТ через развитие интеграции и индивидуализации педагогической деятельности

Информационная открытость и доступность методических материалов для педагогов и родителей, в том числе банк лучших практик.

Большинство дополнительных общеобразовательных программ имеют модуль для особой категории детей - детей с ограниченными возможностями здоровья; детей - сирот, оставшихся без попечения родителей, детей из семей, находящихся в трудной жизненной ситуации.